Proseminar Genom-Informatik/Sequenzanalyse ,
WS
2007/2008
| Dozenten: |
Prof. Daniel Huson, Tobias
H. Kloepper
und Juliane D. Klein |
Kontakt und
Anmeldung:
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Tobias
H. Kloepper.
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| Umfang: |
2 SWS |
| Bereiche: |
B.Sc. Bioinformatik
(empf.
Sem.: 3) |
| Prüfungsfächer: |
B.Sc.
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| Termine: |
Di, 09:15 - 11:00, Raum A
302, Sand
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| Beginn: |
Di, 16. Oktober 2007 |
| Vorbesprechung: |
Di, 16. Oktober 2007, 9:15
Uhr, A302 Sand |
| Sprechstunde: |
Montag, 15:00 - 16:30, C313 Sand |
| Turnus: |
unregelmäßig |
| Voraussetzungen: |
Empfohlen für Studenten
im 3. Semester, nach Rücksprache (Email) auch evtl. ab 1. Semester
möglich |
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| Beschreibung: |
Exemplarisch
werden Aufgabengebiete, Methoden und Algorithmen im Bereich der
Genom-Informatik und Sequenzanalyse behandelt. Jeder Teilnehmer muss
selbständig ein Thema bearbeiten, einen Vortrag vorbereiten und
halten, sowie eine Ausarbeitung von 10- max. 15 Seiten erstellen.
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| Datum |
Beginn |
Vortragstitel |
Vortragender |
Betreuer
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| 30.10.07 |
9:15 |
Basic Concepts in Molecular
Biology |
|
TK
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| 06.11.07 |
9:15 |
Pairwise Alignment Using DP |
|
TK
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| 06.11.07 |
9:15 |
Multiple Sequence Alignment Methods |
|
TK
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| 13.11.07 |
9:15 |
BLAST |
|
TK
|
| 20.11.07 |
9:15 |
Markov Chains And Hidden
Markov Models |
|
TK
|
| 27.11.07 |
9:15 |
Pairwise Alignment Using HMMs |
|
TK
|
| 04.12.07 |
9:15 |
Profile HMMs For Sequence
Families |
|
TK
|
| 11.12.07 |
9:15 |
Sanger- and Pyrosequencing |
|
TK
|
| 18.12.07 |
9:15 |
Fragment Assembly of DNA |
|
TK
|
| 08.01.08 |
9:15 |
Gene Finding With Genscan |
|
TK
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| 15.01.08 |
9:15 |
Genome Rearrangement |
|
TK
|
| 22.01.08 |
9:15 |
RNA Structure Analysis |
|
JK
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| 29.01.08 |
9:15 |
Stochastic Context-Free
Grammars (SCFG) |
|
JK
|
| 05.02.08 |
9:15 |
DNA Computing |
|
JK
|
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Teaching