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Proseminar Sequenzanalyse

Proseminar "Genom-Informatik/Sequenzanalyse", WS 2007/2008

Dozenten: Prof. Daniel Huson, Tobias H. Kloepper und Juliane D. Klein
Kontakt und Anmeldung:
 Tobias H. Kloepper.
Umfang: 2 SWS
Bereiche: B.Sc. Bioinformatik (empf. Sem.: 3)
Prüfungsfächer: B.Sc.
Termine: Di, 09:15 - 11:00, Raum A 302, Sand
 
Beginn: Di, 16. Oktober 2007
Vorbesprechung: Di, 16. Oktober 2007, 9:15 Uhr, A302 Sand
Sprechstunde: Montag, 15:00 - 16:30, C313 Sand
Turnus: unregelmäßig
Voraussetzungen: Empfohlen für Studenten im 3. Semester, nach Rücksprache (Email) auch evtl. ab 1. Semester möglich
 
Beschreibung:
Exemplarisch werden Aufgabengebiete, Methoden und Algorithmen im Bereich der Genom-Informatik und Sequenzanalyse behandelt. Jeder Teilnehmer muss selbständig ein Thema bearbeiten, einen Vortrag vorbereiten und halten, sowie eine Ausarbeitung von 10- max. 15 Seiten erstellen.
Datum Beginn Vortragstitel Vortragender Betreuer
30.10.07 9:15 Basic Concepts in Molecular Biology
TK
06.11.07 9:15 Pairwise Alignment Using DP
TK
06.11.07 9:15 Multiple Sequence Alignment Methods
TK
13.11.07 9:15 BLAST
TK
20.11.07 9:15 Markov Chains And Hidden Markov Models
TK
27.11.07 9:15 Pairwise Alignment Using HMMs
TK
04.12.07 9:15 Profile HMMs For Sequence Families
TK
11.12.07 9:15 Sanger- and Pyrosequencing
TK
18.12.07 9:15 Fragment Assembly of DNA
TK
08.01.08 9:15 Gene Finding With Genscan
TK
15.01.08 9:15 Genome Rearrangement
TK
22.01.08 9:15 RNA Structure Analysis
JK
29.01.08 9:15 Stochastic Context-Free Grammars (SCFG)
JK
05.02.08 9:15 DNA Computing
JK
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