Proseminar Genom-Informatik/Sequenzanalyse ,
WS
2006/2007
| Dozenten: |
Prof. Daniel Huson, Tobias
Dezulian
und Christian Rausch |
Kontakt und
Anmeldung:
|
Tobias
Dezulian.
Das Seminar hat begonnen, keine weiteren Anmeldungen sind möglich.
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| Umfang: |
2 SWS |
| Bereiche: |
B.Sc. Bioinformatik
(empf.
Sem.: 3) |
| Prüfungsfächer: |
B.Sc.
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| Termine: |
Di, 08:30 - 09:30, Raum A
301, Sand
1
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| Beginn: |
Di, 17. Oktober 2006 |
| Vorbesprechung: |
Di, 17. Oktober 2006, 8:30
Uhr, A301
Sand |
| Sprechstunde: |
Montag, 16:00 - 17:30, C324b
Sand |
| Turnus: |
unregelmäßig |
| Voraussetzungen: |
Empfohlen für Studenten
im 3.
Semester, nach Rücksprache (Email) auch evtl. ab 1. Semester
möglich |
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| Beschreibung: |
Exemplarisch
werden Aufgabengebiete, Methoden und Algorithmen im Bereich der
Genom-Informatik und Sequenzanalyse behandelt. Jeder Teilnehmer muss
selbständig ein Thema bearbeiten, einen Vortrag vorbereiten und
halten,
sowie eine Ausarbeitung von 10- max. 15 Seiten erstellen.
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| Datum |
Beginn |
Vortragstitel |
Vortragender |
Betreuer
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| 31.10.06 |
8:00 |
Basic Concepts in Molecular
Biology |
David Roztocil |
TD
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| 31.10.06 |
8:30 |
Sanger- and Pyrosequencing |
Gergana Andreeva |
CR
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| 07.11.06 |
8:30 |
Pairwise Alignment Using DP |
Christoph Grotz |
TD
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| 14.11.06 |
8:30 |
BLAST |
Patricia Molina |
TD
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| 21.11.06 |
8:00 |
Fragment Assembly of DNA |
Kirsten Heitmann |
TD
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| 21.11.06 |
8:30 |
Markov Chains And Hidden
Markov Models |
Dominikus Krüger |
CR
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| 28.11.06 |
8:30 |
Profile HMMs For Sequence
Families |
Lena Veit |
CR
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| 05.12.06 |
8:30 |
Gene Finding With Genscan |
Marina Müller |
CR
|
| 12.12.06 |
8:00 |
Pairwise Alignment Using HMMs |
Stephan Dabels |
CR
|
| 12.12.06 |
8:30 |
Multiple Sequence Alignment
Methods |
Johannes Junker |
CR
|
| 19.12.06 |
8:30 |
DNA Computing |
Martin Rötzschke |
TD
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| 09.01.06 |
8:30 |
Stochastic Context-Free
Grammars (SCFG) |
Nina Oppitz |
TD
|
| 16.01.06 |
8:30 |
RNA Structure Analysis |
Veronika Wahl |
TD
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| 23.01.06 |
8:30 |
Poplar Genome Sequence
Analysis |
Jana Kneslova |
TD
|
| 30.01.06 |
8:30 |
Gene Drive Systems For
Insect Disease Vectors |
Daniel Vogel |
TD
|
| 06.02.06 |
8:30 |
Genomic Mapping And
Positional Cloning With Emphasis On Plant Science |
Julija Negerisa |
CR
|
| 13.02.06 |
8:30 |
Introduction to
Support Vector Machines and application: Substrate Specificity
Prediction Of Enzymatic Subtypes With Support Vector Machines |
Philipp Bruns |
CR
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Teaching