Proseminar "Genom-Informatik/Sequenzanalyse"

Proseminar "Genom-Informatik/Sequenzanalyse", WS 2006/2007

Dozenten:	Prof. Daniel Huson, Tobias Dezulian und Christian Rausch
Kontakt und Anmeldung:	Tobias Dezulian. Das Seminar hat begonnen, keine weiteren Anmeldungen sind möglich.
Umfang:	2 SWS
Bereiche:	B.Sc. Bioinformatik (empf. Sem.: 3)
Prüfungsfächer:	B.Sc.
Termine:	Di, 08:30 - 09:30, Raum A 301, Sand 1

Beginn:	Di, 17. Oktober 2006
Vorbesprechung:	Di, 17. Oktober 2006, 8:30 Uhr, A301 Sand
Sprechstunde:	Montag, 16:00 - 17:30, C324b Sand
Turnus:	unregelmäßig
Voraussetzungen:	Empfohlen für Studenten im 3. Semester, nach Rücksprache (Email) auch evtl. ab 1. Semester möglich


Beschreibung:
Exemplarisch werden Aufgabengebiete, Methoden und Algorithmen im Bereich der Genom-Informatik und Sequenzanalyse behandelt. Jeder Teilnehmer muss selbständig ein Thema bearbeiten, einen Vortrag vorbereiten und halten, sowie eine Ausarbeitung von 10- max. 15 Seiten erstellen.

Datum	Beginn	Vortragstitel	Vortragender	Betreuer
31.10.06	8:00	Basic Concepts in Molecular Biology	David Roztocil	TD
31.10.06	8:30	Sanger- and Pyrosequencing	Gergana Andreeva	CR
07.11.06	8:30	Pairwise Alignment Using DP	Christoph Grotz	TD
14.11.06	8:30	BLAST	Patricia Molina	TD
21.11.06	8:00	Fragment Assembly of DNA	Kirsten Heitmann	TD
21.11.06	8:30	Markov Chains And Hidden Markov Models	Dominikus Krüger	CR
28.11.06	8:30	Profile HMMs For Sequence Families	Lena Veit	CR
05.12.06	8:30	Gene Finding With Genscan	Marina Müller	CR
12.12.06	8:00	Pairwise Alignment Using HMMs	Stephan Dabels	CR
12.12.06	8:30	Multiple Sequence Alignment Methods	Johannes Junker	CR
19.12.06	8:30	DNA Computing	Martin Rötzschke	TD
09.01.06	8:30	Stochastic Context-Free Grammars (SCFG)	Nina Oppitz	TD
16.01.06	8:30	RNA Structure Analysis	Veronika Wahl	TD
23.01.06	8:30	Poplar Genome Sequence Analysis	Jana Kneslova	TD
30.01.06	8:30	Gene Drive Systems For Insect Disease Vectors	Daniel Vogel	TD
06.02.06	8:30	Genomic Mapping And Positional Cloning With Emphasis On Plant Science	Julija Negerisa	CR
13.02.06	8:30	Introduction to Support Vector Machines and application: Substrate Specificity Prediction Of Enzymatic Subtypes With Support Vector Machines	Philipp Bruns	CR