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Selected Topics in Bioinformatics |
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Seminar Topics in Bioinformatics , SS 2006
| Arbeitsbereich: |
Algorithmen der Bioinformatik |
| Dozent: |
Huson, Rausch, Klöpper |
| Umfang: |
2 SWS |
| Bereiche: |
Hauptstudium (empf. Sem.: 6ff) |
| Prüfungsfächer: |
Nicht zutreffend! |
| Termine: |
Do, 08:00 - 10:00, Raum A 302, Sand 1
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| Beginn: |
27. April 2006 |
| Vorbesprechung: |
27. April 2006 |
| Sprechstunde: |
Regelsprechstunde Prof. Huson / Christan
Rausch / Tobias Kloepper |
| Homepage: |
http://www-ab.informatik.uni-tuebingen.de/teaching/ss06/welcome.html |
| Turnus: |
2-semestrig |
| Voraussetzungen: |
Ab 6. Semester. |
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| Beschreibung: |
| Ausgewaehlte Themen aus der Bioinformatik
werden von den Teilnehmern erarbeitet und in je einer Sitzung
vorgestellt. |
Themen:
Datum
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Titel
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Vortragender
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Betreuer
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18.05.
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MUSCLE: multiple
sequence alignment with high
accuracy and high throughput (pdf) |
David J. Mack
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Tobias Klöpper
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01.06.
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Gibbs Motif Sampler
allows to identify motifs,
conserved regions, in DNA or protein sequences (reference) |
Julian Heinrich
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Christian Rausch
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22.06.
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Introduction to
Principal Component Analysis (PCA)
(own literature searches) |
Jonas Müller
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Christian Rausch
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29.06.
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MEME: Fitting a
mixture model by expectation
maximization to discover motifs in biopolymers (orig. paper,
example, meta-meme) |
Benjamin Lenz
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Christian Rausch
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06.07.
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Reconstructing
pedigrees: A combinatorial perspective (pdf) |
Katharina Buck
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Tobias Klöpper
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13.07.
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Partial Least
Squares (a pdf, a book chapter) |
Sabine Reusig
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Tobias Klöpper
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| Bemerkungen: |
| The presentations given in this seminar will be held in English. |
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Teaching